Casals de Joves de Catalunya organitza les seves activitats i accions pels següents programes definits de treball:
- ACCIÓ SOCIAL. Coordina accions de reivindicació social com les campanyes de sensibilització, les manifestacions, el treball de reflexió o la promoció de la consciència crítica.
- INTERNACIONAL. Ofereix als casals contactes i suport per a realitzar activitats internacionals, promou la participació dels joves en seminaris i intercanvis i coordina la participació dels i les joves dels casals en alguns d'aquests intercanvis.
- PEDAGÒGIC. Impulsa i gestiona la formació que s'ofereix a joves i animadors i animadores juvenils. Organitza cursos i tallers sobre participació juvenil i dinamització juvenil, com ara les Jornades de Participació i debat, el curs d’animadors/es juvenils o els monogràfics
- PROJECTES CULTURALS. Coordina les accions i activitats culturals que s’organitzen entre tots els casals com són les Trobades de Joves, el Circuit de Música Sonat o el Torneig de futbito.
- SALUT. Promou la salut als Casals de Joves. Des d'aquest àmbit s'ofereixen recursos, material i assessorament als casals per a treballar aquest tema. Actualment, les línies de treball principals se centren en la sexualitat i les drogues.
- SECUNDÀRIA. Fomenta la participació als centres educatius de secundària. Pretén impulsar la cultura participativa de l’alumnat als diferents àmbits de la seva vida, tant dintre com fora del centre escolar.
- TIC. Dinamitza, forma i promou l’ús de les Tecnologies de la Informació i comunicació (TIC). El projecte e-TIC's busca democratitzar les TIC fent-les accessibles a totes les persones, oferint formacions adequades i promovent-ne l’ús ètic, crític i responsable.
